頂空瓶基本以玻璃材質為主，極少是塑料材質。一次性使用的進樣瓶成本高、浪費大、對環境污染嚴重，大多實驗室都是將進樣瓶清洗后重復利用。目前，實驗室常用清洗進樣瓶的方法主要都是加入洗衣粉、洗滌劑、有機溶劑及酸堿洗液，然后用定制的小試管刷洗。這種常規的刷洗法缺點很多，洗滌劑和水的使用量大，洗滌用時長，容易留有死角，如果是塑料進樣瓶，易在內部瓶壁留下刷痕，占用大量人力資源。對于脂質和蛋白質殘留污染嚴重的玻璃器皿，采用堿性裂解液進行清洗，取得良好的效果。
方案一：
1、倒干瓶內試液2、全部浸入95%酒精，超聲洗2次后倒干，因為酒精易進入1.5mL的小瓶，且能與大多數有機溶劑互溶以達到清洗效果。3、倒入清水，超聲洗2次。4、倒干瓶內洗液，于110攝氏度烘1~2小時，絕對不能于高溫下烘烤。5、冷卻，保存。
方案二：
1、自來水沖洗幾遍2、放入倒有純水的燒杯中，超聲15分鐘3、換水，再超聲15分鐘4、泡在倒有無水乙醇的燒杯中5、最后取出自然風干。
方案三：
1、先用甲醇(色譜純）浸泡，并超聲清洗20分鐘，后將甲醇倒干.2、再將進樣瓶內注滿水，超聲清洗20分鐘，后將水倒干.3、后將進樣瓶烘干
方案四：
（第一種）、一般都是先用清水沖洗烘干后再用硫酸重鉻酸鉀洗液浸泡（第二種）、進樣瓶的洗法和做液相等其他是一樣的，首先使用醫用酒精侵泡4個小時以上，然后超聲半個小時，然后倒出醫用酒精，使用水超聲半個小時，用水沖洗后烘干就可以了。
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